儀器簡介 & 測定項目
Introduction:
儀器簡介:
美國「Akoya Bioscience」公司的「CODEX系統」提供了組織影像擷取及分析上的全新突破,
此技術利用獨特的寡核苷酸序列作為Barcodes接合於單株抗體上,
帶有Barcodes的抗體們可先全部施加於組織片上,一次標示所有的目標蛋白標記,
接下來將帶有螢光團且序列互補的寡核苷酸序列(Reporters)一次三個一組地施加於組織片上
,完成第一輪影像擷取,擷取後利用專門技術移除第一輪的Reporters,
再施加新一輪的不同Reporters,完成第二輪的影像擷取,
如此反覆進行最多可一次觀察多達40多種組織標的物的標示分析,
對比目前一般的技術,組織片螢光標示一次呈現最多的蛋白標記約為4-6個,可看出此技術的能力卓越。
CODEX系統可提供校內及附院關於免疫癌症學、神經學、心血管、病毒學等研究領域上前所未有的突破,
血液學等常用的懸浮細胞檢體亦可透過離心貼覆於玻片的方式來觀察分析,
彌補一般流式細胞儀最多看10多色的不足。系統支援的研究領域廣泛,
呈現的結果深度顯著,近年來國際頂尖期刊發表內容已可見此趨勢。
功能應用:
1. 本機配備有雷射自動對焦系統及20X物鏡,可同時偵測 4 種螢光光源 (AF488, ATTO550, AF750, Cy5 )。
2. 簡單且自動化之流體分析平台:可自動染色、拍攝、去除螢光,自動重複上述過程,減少人力負擔增加實驗效率。
3. Multiplex Analysis Viewer (MAV)分析軟體可進行影像漂移補償、影像背景扣除、細胞分割和聚類、
空間網絡圖的製作,進而產生可視化的分組資料,提供完整的組織空間圖。
4. 同一片組織檢體,可同時觀察超過40種以上標記蛋白質。
5. 適用於組織冷凍切片、石蠟包埋切片分析。經系統處理後,組織可保持自身結構完整性,可另再進行H&E染色。
本組既有抗體表單:
原廠NEW-抗體試劑手冊
*CODEX® MAV分析軟體下載:請照原廠網站說明執行,下載點。*
申請流程 & 注意事項
CODEX 實驗流程注意事項!!!
1. 使用者需先與技術員進行實驗設計諮詢,待完全了解實驗流程並完成繳費後,方能預約使用儀器。
2. 本儀器採網路預約方式,請依照抗體數量及檢體片數,預約儀器使用時數。
3. 儀器預約時間須與前一位使用者上機完成後間隔至少3天。
4. 組織切片請自行製備,本組不協助處理組織切片;切片抗體標記亦須自行操作,
唯可攜帶實驗相關試劑耗材至本組研究室,請技術員從旁協助指導實驗操作。
5. 每一切片建議至少標記6支抗體再上機,其抗體數量建議以3的倍數進行標記實驗。
6. 本儀器全程由技術員操作,使用者不可擅自操作儀器。
7. 儀器運作、資料處理及轉檔期間,不可隨意碰觸儀器及電腦,以免影響儀器正常運作。
8. 本組僅提供gating後的分析資料,後續之數據分析須由使用者自行分析。
9. 研究資料請自行準備已格式化之隨身硬碟,經技術員確認許可後方能存取;本組代為保存檔案期限為6個月,超過期限之檔案,經技術員與使用者聯繫且同意刪除後再執行刪除作業。
10. 儀器發生故障時,請儘速通知管理人員,勿自行拆裝儀器或任意調整儀器參數。
11. 因個人因素操作不當造成儀器損壞,需由個人所屬實驗室負擔維修相關費用。
使用收費標準
超高內涵組織掃描暨分析系統CODEX繳費單
**現金繳費者,請持本表單至出納組繳費取得出納章印後將正本繳回給儀器操作管理人員存查。
**繳費金額大於3000元以上,得以計畫經費核銷,請持本表單影本及付款憑證(需有傳票編號),繳回給儀器操作管理人員存查。
中心現有抗體清單對照表:
Human Fresh Frozen Targets
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廠牌
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Mouse Fresh Frozen Targets
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廠牌
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CD45—Alexa FluorTM 488-RX001
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Akoya
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Pdgfrb—Alexa FluorTM 488-RX004
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Abcam
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CD38—Alexa FluorTM 488-RX007
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Akoya
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CD45—Alexa FluorTM 488-RX007
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Akoya
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Epcam—Alexa FluorTM 488-RX010
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Abcam
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a-SMA—Alexa FluorTM 488-RX013
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Abcam
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CD11b—Alexa FluorTM 488-RX025
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Akoya
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CD2—Atto 550-RX002
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Akoya
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CD31—Atto 550-RX002
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Akoya
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CD104—Atto 550-RX005
|
Akoya
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Vim — Atto 550-RX005
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Abcam
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Csf1r — Atto 550-RX014
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Abcam
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CCR2 —Atto 550-RX017
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NOVUS
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CX3CR1—Atto 550-RX020
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NOVUS
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Ki67—Atto 550-RX047
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Akoya
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CD19—Cy5-RX003
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Akoya
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Ly6g—Alexa Fluor 647-RX024
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Akoya
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CD11—Cy5-RX027
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Akoya
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CD11c—Alexa Fluor 647-RX030
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Akoya
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實驗範例