課程名稱
研究技術新知-【WES/WGS 序列分析+變異位點判讀-分析實做】
時間:110年05月06日 09:00-12:00
地點:勵學大樓3樓半 視聽中心
報名網站: https://forms.gle/RHU5VF6oPA1u3i4e6
當天會提供軟體教學帳號實際操作,歡迎老師與同學攜帶筆電踴躍報名參加。
特色及應用
內容包含:WES/WGS 資料分析(Import, QC, Mapping) →Variant calling→變異位點檔案上傳→資料庫判讀&註釋→報告產生
此次演講針對NGS前端數據分析至後續變異位點注釋判斷,皆提供簡單直覺式的分析流程,並針對NGS數據提供文獻驗證之變異點註釋與臨床佐證資料。在CLC序列分析平台,會先針對長序列/短序列的NGS數據進行QC、Mapping reference、Variant Calling,最後生成VCF檔後上傳至QCII變異位點篩選判讀軟體,提供最終出臨床報告之各項系統環節,包含報告檢閱、並展示如何以QCIT軟體中不同的分析以及篩選方式,找出關鍵的變異位點。實現在NGS數據分析及位點評斷最流暢也迅速可靠的解決方案。
主要內容包括:
1. CLC 序列拼裝分析平台介紹:
• 支援人類、微生物及其他物種之基因序列分析。並專注在定序或晶片等高通量資料產出之初始資料的拼裝整合,並針對不同定序型式,如基因體全定序、外顯子全定序、RNA定序或微生物體學定序資料,設計自動化資料處理流程。
2. QCII 變異位點用藥資訊暨報告系統:
• QCII是專門為實驗室評估次世代定序(NGS)數據而設計的變異位點解釋和篩選軟體。 透過QIAGEN知識庫中超過1000萬筆相關生物醫學發現來註釋、評估和報告NGS變異位點。在分析中QCIT的網頁介面,讓您快速並直覺化的分析疾病之位點資訊,並產生疾病位點點判讀報告。
教育訓練議程表
時間 |
課程內容 |
地點 |
09:00-09:30 |
報到 |
勵學大樓3樓半 視聽中心 |
09:30-10:30 |
CLC 序列拼裝分析平台介紹; 1. NGS Data Import(Long/short reads ) 2. QC/MAPPING/CALL VARIANT 3. VCF Data Output |
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10:30-11:30 |
QCII 變異位點用藥資訊暨報告系統 1. VCF data upload 3. 報告及藥物注釋資料輸出 |
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11:30-11:50 |
Q&A |
報名網址
https://forms.gle/RHU5VF6oPA1u3i4e6
注意事項
1. 請於110.05.01 PM16:00前,於研究資源整合發展中心網站線上報名。
2. 若有任何問題可與本中心洪志昌先生聯繫 分機:2370#25。
儀器/課程諮詢
管理人員:洪志昌 分機:2370#25
中心主任:許雅玲 分機:2136#26