*上課講義下載:
1. 112.12.07_上午課程講義_Partek Flow ChIP+RNA-seq
2. 112.12.07_下午課程講義_Partek Flow scRNA-seq
課程名稱
撰寫計畫美圖好幫手-高通量基因體資訊分析軟體 Partek Flow教育訓練
時間:112年12月07日 (四) 9:00-17:00 (08:50開始報到)
地點:勵學大樓三樓半視聽中心
本課程採實名制,現場發與hands-on demo帳號
請自備筆電,全程參與課程
特色及應用
次世代定序所產生龐大的資料量,在資料分析時常造成生物背景的研究者的困境,
而「高通量基因體資訊分析軟體 Partek Flow 」專注於NGS高通量數據開發的綜合分析軟體,
支援RNA-seq、single-cell RNA-seq、DNA-seq、ATAC seq、ChIP seq、Metagenomic Seq等,
並整合多種常見的分析流程(如BWA, Bowtie, STAR, TopHat等)、統計模型(如T-test, Anova等)、
圖型化的介面(如Chromosome View、Dot Plot、Volcano Plot、Hierarchical clustering等)以及直覺式的分析流程設計,
讓基因體學的研究人員無需藉由程式語言也能完成數據分析。
此外,「高通量基因體資訊分析軟體 Partek Flow 」亦支援新興single-cell RNA expression研究分析,
可了解特定基因在不同細胞中的RNA表現量,並觀察特定細胞群中(subgroup)基因表現量的差異。
其中「Trajectory Analysis」功能將不同的細胞群依照基因的表達量來預測發育細胞的分化軌跡或細胞的演化過程,
可以藉此區分樣品中的親代細胞(如幹細胞)及分化後的細胞類型。
本教育訓練課程將藉由「高通量基因體資訊分析軟體 Partek Flow 」的協助,
帶領各位研究人員了解定序數據分析方法與應用成果,將更進一步幫助您於未來各項計畫案中有更新穎之研究規劃與數據呈現。
教育訓練議程表
上課日期 |
時間 |
課程內容 |
地點 |
112.12.07(四) |
08:50-09:10 |
學員報到 |
勵學大樓 三樓半 視聽中心 |
09:10-09:30 |
Partek Flow軟體 introduction |
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09:30-10:30 |
DNA seq hands-on |
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10:40-12:00 |
Bulk RNA seq hands-on |
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12:00-13:30 |
中午休息時間 |
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13:40-16:30 |
Single cell RNA seq hands-on |
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16:30- |
Q&A |
請自備筆電,現場發與30名hands-on demo帳號
報名網址
https://forms.gle/oawTK6DMMuZYTnve7
注意事項
1. 請於112.12.04 PM16:00前,於研究資源整合發展中心網站線上報名。
2. 若有任何問題可與本中心洪志昌先生聯繫分機:2370#25。
3. 主辦方有權依針對部分課程更動上課時間及比例。
4. 基於防疫政策,請全程配戴口罩禁止飲食。
儀器/課程諮詢
管理人員:洪志昌分機:2370#25
中心主任:許雅玲分機:2136#26