---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
教育部高教深耕計畫
構面三-產學合作連結─「專業加值暨產學共培共學增能計畫」
核心議題二-推動產業導向多元課程模組，發展彈性學習地圖
策略1：鏈結校/院特色研究，賡續開辦學術研究為導向之實務培訓
課程代碼：B-4
課程名稱：【高通量資料分析系列課程：單細胞RNA定序數據分析課程】
時間：112年09月07日 (四) 08:30-17:00 (08:30開始報到)
地點：高雄醫學大學 國研大樓 3樓電腦教室 IR335
研習對象：全校院教職員師生等人
人數限制：50人
課程目標：
課程目的係認識如何利用高通量數據(high-throughput data)所提供之特殊機會，
來提高生物醫學實驗之真實性(validity)與再現性(reproducibility)，並促進各相關領域的合作。
在各種高通量數據產生之技術平台中，單細胞RNA定序（single-cell RNA sequencing）技術近來發展趨於成熟的重要技術，
已經在腫瘤學、免疫學、以及發育生物學的各研究領域逐漸被大量應用。
本次研習課程擬安排簡介此技術之基本原理與資料產生之流程，
及現有商用平台與開放平台可用以此分析之套裝軟體，進一步透過實機操作學習數據分析流程與其使用之方法，
並將著重於資料品質控制之議題，適合對單細胞技術應用與其資料分析有興趣者參加，
期望讓研究者在實務概念與技術都能一次獲得，並大幅提升本校研究生在轉譯醫學和精準醫療的研究能力。
課程內容/議程：
|
日期 |
時間 |
內容大綱 |
講師 |
地點 |
|
112.09.07(四)
|
08:30 I 09:00 |
學員報到/長官開場 |
許雅玲教授/主任 |
國研大樓3F IR335 電腦教室 |
|
09:00 I 10:00 |
單細胞RNA定序資料產生之簡介 |
江士昇 副研究員 |
||
|
10:00 I 11:00 |
公共資料庫中單細胞RNA定序資料的應用 |
江士昇 副研究員 |
||
|
11:00 I 12:00 |
單細胞RNA定序資料分析軟體 簡介與實作 R package: Seurat |
蔡芳榆 技術員 江士昇 副研究員 |
||
|
13:30 I 15:30 |
網頁互動式單細胞RNA定序資料分析軟體簡介與實作 |
黃柏榕 副教授 蔡芳榆 技術員 |
||
|
15:30 I 16:30 |
以單細胞RNA 定序資料為基礎之 細胞間交互作用分析之簡介與實作 |
吳怡儒 博士 蔡芳榆 技術員 |
||
|
16:30 I 17:00 |
Q&A 綜合討論時間 |
|
本研習課程邀請：
【國科會生技醫藥生物核心設施】之頂尖學者，
國家衛生研究院癌症研究所江士昇助研究員、陳中興助研究員、黎彥良博士後學者與蔡芳榆研究助理等人，
講授單細胞RNA定序技術、演進與現行平台之簡介，
並教導參與學員如何處理這些數據及利用各種生物資訊軟體及資料庫進行運算和分析，
提高生物醫學實驗之真實性(validity)與再現性(reproducibility)，
並透過產業界介紹現有商用平台與開放平台可用以此分析之套裝軟體，
進一步透過實機操作學習數據分析流程與其使用之方法，藉以提供更有力的證據來支持生物醫學研究。
此一課程將能大幅提高參與學員具有高速及大量分析研究或臨床病人檢體之能力，使學員:
１. 了解單細胞RNA定序技術原理及技術平台之演進及未來發展方向，產出數據之意義及於臨床檢測之進階應用。
２. 藉由教學及實際操作，使參與學員了解Gene set variation analysis (GSVA)。
３. 藉由教學及實際操作生物醫學數據處理與圖表製作，學習自動化資料處理與分析的方法，
產出高可靠性 與高再現性的分析結果，使參與學員了解透過互動式生物資訊工具了解分析策略與歸納差異化基因表現。
４. 培養及加深參與學員之研究能力，並能接軌至國家重點發展之生醫產業及醫療發展。
５. 聚焦於本校各生醫研究，強化本校研究能量及在個人化精準醫療相關人才之培育
注意事項：
1. 本課程限額50名，參與者須全程配戴口罩，若有身體不適者請暫緩參與。
2. 報名成功者課前一週會發送報名成功通知信。
3. 若有任何問題可與本中心周季賢/洪志昌先生聯繫 分機：2371#27 or 2370#25。
儀器/課程諮詢：
管理人員：洪志昌 分機：2370#25
中心主任：許雅玲 分機：2136#26
