管理人員: 洪志昌 分機:2370#25 E-Mail:allenhcc@kmu.edu.tw
PartekFlow
Partek Flow 專注於NGS高通量數據開發的綜合分析軟體,
支援RNA-seq、single-cell RNA-seq、DNA-seq、ATAC seq、ChIP seq、Metagenomic Seq,
並整合多種常見的分析流程 (例BWA, Bowtie, STAR, TopHat等)及統計模型(例T-test, Anova等),
圖型化的介面(例Chromosome View、Dot Plot、Volcano Plot、Hierarchical clustering等)
以及直覺式的分析流程設計,讓基因體學的研究者們無需藉由程式語言也能完成數據分析。
Partek Flow支援新興single-cell RNA expression研究分析,
可了解特定基因在不同細胞中的RNA表現量,並觀察特定細胞群中(subgroup)基因表現量的差異。
其中Trajectory Analysis功能將不同的細胞群依照基因的表達量來預測發育細胞的分化軌跡或細胞的演化過程,
可以藉此區分樣品中的親代細胞(如幹細胞)及分化後的細胞類型。
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